Os sistemas de desinfeção UV inativam os microrganismos patogénicos como vírus, bactérias e parasitas. No espectro da luz UV-C (200-280 nm), o comprimento de onda de 254 nm é o mais eficiente para inativar os microrganismos, devido aos danos provocados nas cadeias de ácidos nucleicos (DNA e RNA). Uma vez inativos, os microrganismos são incapazes de se reproduzir.

A tecnologia UV tem a vantagem de não deixar residual, nem formar subprodutos da reação, o que a elege como uma tecnologia adequada para a desinfeção de águas de processo da indústria alimentar.